vagrant内のmysqlにworkbenchでアクセスする

sshを使ってやるのがいいと思います
vagrant内のmysqlは外からつながるようにしておいて

参考)mysqlに外からアクセスする

workbenchの設定はこんな感じ

workbench

Connection Method: Standard TCP/IP over SSH
SSH Hostnam : 127.0.0.1:2222
SSH username : vagrant
MySQL Hostn : 127.0.0.1
MySQL Server : 3306
Username : user

ユーザーとパスワードは環境に合わせてください

Workbenchでつなぐときに
known_hostsを消せ、とかエラーが出たら

$ ssh-keygen -R [127.0.0.1]:2222

で回避できます

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